细胞（杂交瘤细胞、B细胞、单个B细胞）
| 服务包 | 交付周期 Updated (从开始) |
默认交付 | 可选交付 | |
|---|---|---|---|---|
| Sanger测序 | 抗体可变区 | 10个工作日 |
测序报告包括：
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| 全长抗体 | 12个工作日 | |||
| NGS测序 | 高通量测序 | 10个工作日 |
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注：
a) 样品要求：
数量：>1×106个细胞; 物种： 人，小鼠，大鼠，兔，雪貂等。
b) 附加服务：1. 高通量重组抗体表达服务 2. 大规模抗体生产服务 3. 抗原抗体结合确认。
目标：开发4-1BB特异性抗体
免疫：4-1BB胞外区
结果：获得了107株4-1BB抗体，并使用高通量NGS抗体测序平台分析了基因组信息
1. 系统进化树分析-VH区
在 107 个克隆中，有 5 个克隆显示出与其他克隆相同的V区。
2. 系统进化树分析-VL区
在107个克隆抗体中，有6个克隆与其他克隆显示相同的V区。
3. Germline分析（表明抗体多样性）
4. CDR长度分析（表明候选抗体）
1. 保存抗体多样性： 杂交瘤测序直接对杂交瘤细胞产生的抗体进行测序，这保留了抗体的多样性。相反，从头抗体测序依赖于分离单个抗体，并且可能无法捕获免疫应答中存在的全部多样性。
2.时间和成本效率： 与从头抗体测序相比，杂交瘤细胞测序是一种更具时间和成本效益的方法。
3. 质量控制和确认: 由于序列是从杂交瘤细胞本身获得，因此可以确保该抗体确实是由杂交瘤细胞产生。在从头测序中，需要额外的验证步骤来确认获得序列的真实性。
4. 与已确定的杂交瘤系的相容性: 杂交瘤细胞系具有明确的追溯历史，已知的特性和可追溯的文件，为抗体测序提供大量的信息，有助于进一步表征和开发。
5. 区分某些氨基酸： 蛋白质测序在区分特定氨基酸（如亮氨酸和异亮氨酸）时会遇到挑战，这可能导致在最终序列中引入错误。相反，杂交瘤测序直接对抗体产生细胞的cDNA进行测序，消除了潜在问题，并产生更精确、准确和可靠的结果。
1. 研究目标：如果您需要测定抗体的完整编码序列（其中包括可变区和恒定区），可使用Sanger测序法。然而，如果您需要对抗体库进行全面分析，包括克隆多样性和罕见或低丰度变异体的鉴别，NGS可以提供更全面的描述。
2.样品数量：评估需要测序的样品数量。Sanger测序法繁琐且成本较高，适用于少量样品。另一方面，NGS测序平台提供更高的通量，使得能够同时对大量样品进行测序。
3. 成本考虑：评估您的预算和资源。通常使用Sanger测序法，对小规模项目或对有限数量的样品进行测序时更具成本效益。由于文库准备、测序和数据分析相关的前期成本较高，NGS可能更昂贵。但是，对于大规模项目或测序样品较多时，NGS更具成本优势。
4. 序列准确度： 评估您的研究所需序列准确度水平。Sanger测序法长期以来以准确度高而闻名，特别是在获得单个完整序列方面。NGS平台的测序一般是准确的，但具有较高的误差率，特别是在同聚物区域或重复序列方面。您需要考虑两种方法中哪一种可以满足项目的特定准确度要求。
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