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引物池助力碱基编辑器, 让遗传变异的大规模功能表征更高效

2月18日,博德研究所的Ruth E. Hanna等在Cell杂志上发表文章,报道了一种利用CRISPR-Cas9胞嘧啶碱基编辑器的基因池筛选方法,用于对人类单核苷酸变异的大规模并行性评估,其中,基于引物池合成的sgRNA文库,为加速研究推波助澜。该研究突破了罕见病研究和癌症基因组学的变异表征瓶颈,对在临床中表征未知功能变异具有深远意义。

研究背景

单核苷酸变异筛选对于表征可能导致某些罕见疾病的突变至关重要。然而,目前的筛选方法还远远不能令人满意。例如,饱和诱变(Saturation mutagenesis)只适用于产生小基因的单核苷酸变异,而利用Cas9介导同源重组修复(Homology directed repair,HDR)的饱和基因组编辑筛选(Saturation genome editing screens)又存在着在人体细胞中效率低下的问题。因此,RuthE. Hanna等意识到需要一种新的筛选方法来实现简单、可预测和可度量的变体筛选。

本研究的图解摘要 *图片来自Cell杂志网站

实验路线

Ruth E. Hanna等使用胞嘧啶碱基编辑器对哺乳动物细胞中的遗传变异进行了混合筛选,以便对其进行定量评估。

黄金城集团引物池技术,为该研究中sgRNA文库提供了更节省时间与经费成本的高质量建库方案。

实验结果

相关服务

本研究中使用的引物池由黄金城集团合成。引物池合成服务一次性合成多达91,766条引物,序列覆盖率99%以上,碱基单价低至1分钱,让您不再为预算和周期而烦恼,专心进行合成生物学研究、靶向测序及复合DNA文库实验等,将您的所有科研设想变成现实。

参考资料

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