多克隆抗体是多种免疫球蛋白的集合，每种免疫球蛋白由不同的B细胞克隆产生。这些抗体会瞄准单个抗原上的不同表位或结合位点。多克隆抗体由多个B细胞克隆产生，随后靶向多个表位，这就是多克隆抗体与单克隆抗体的区别所在。
所有抗体的生成，无论是多克隆抗体还是单克隆抗体，均始于激发免疫反应，即所谓的免疫。预期目标被注射到宿主体内，被免疫系统识别为外来物，并被抗体靶向进行免疫阻断或清除。未能诱发免疫应答时还需要使用佐剂，即免疫原性物质如费氏佐剂或钥孔血蓝蛋白（KLH）来进一步推动免疫招募。免疫是多克隆制备的重要环节。典型的免疫应答概述如下。
初次免疫应答
抗原和适当的添加佐剂与宿主的初始暴露又被称为“初次”免疫。典型的免疫注射方法包括皮肤注射、腹膜注射、皮下注射或肌肉注射。不常见的替代方法还有口服和鼻内给药。DNA免疫也是一种新兴技术，可用于毒性抗原或其他难以生产的抗原。任何后续的抗原暴露则称为“加强”免疫。
通过抗原提呈细胞进行抗原加工
巨噬细胞、树突细胞（DC）以及少量B细胞等所有抗原提呈细胞（APC）会通过内吞作用或吞噬作用将抗原内化。抗原加工将抗原断裂呈更小的片段，然后将这些片段转移到APC的表面。
B细胞的刺激
辅助T细胞识别APC表面的抗原后会释放刺激信号分子--细胞因子。这些细胞因子会激活B细胞，而B细胞同样会通过其B细胞受体（BCR）识别出抗原。有些B细胞在BCR与抗原相互作用后不需要辅助T细胞的激活，通常会产生较快的免疫反应，并产生亲和力较低的抗体。辅助T细胞的参与对完整的免疫反应和调节自身耐受性至关重要。
B细胞增殖和抗体分泌
活化的B细胞分裂后形成记忆B细胞和血浆细胞群。这两种类型的细胞都能识别相同的抗原表位。血浆细胞将抗体分泌到血清内用以进行免疫识别，而记忆B细胞则持续较长时间，对二次接触相同抗原做出快速反应。
在免疫过程中，需要测量抗体水平以评估免疫进展。对比免疫后的血清样品与免疫前的血清样品开展针对靶抗原的ELISA测定，从中揭示免疫所触发的免疫应答程度。通过样品连续稀释来决定抗体的滴度。以1:64,000的滴度视为免疫应答合格基准，然后进入血清采集或淋巴细胞融合缓解。滴度较低的抗体可能需要后续的加强免疫、其他给药途径或额外的佐剂。
多克隆抗体的生产只需从宿主动物体内采血，并将细胞部分与含有分泌抗体的血清部分分离。由于很多抗原特异性抗体都通过多种活化B细胞来分泌，而且血清含有多种不同抗体克隆产物，因此将其称为多克隆抗体。具体而言，针对于一种抗原的多种克隆抗体的制备方式是将抗原加工成片段，而且每个片段含有更小的区域，即所谓的抗原表位。每一个表位都能被特定的BRC所识别。不同的B细胞群会分泌出特定的、但同样针对于同一种抗原的不同抗体。此外，血清不仅含有专门针对意向靶点抗原的抗体，同时还存在针对于其他靶点、药物、激素等的免疫球蛋白。血清可以直接用作分子生物学探针，但通常需要进一步的纯化才能提高某一具体化验测定的灵敏度和特异性。亲和纯化可实现不同程度的抗体回收，具体取决于以下所示的技术，但都达不到单克隆抗体的表位水平特异性。
| 亲和纯化技术 | 优点 | 缺点 |
|---|---|---|
| 蛋白质A/G | 简单，高性价比 | 回收所有免疫球蛋白 |
| 抗原特异性 | 仅回收抗原特异性抗体 | 需要使用非微量抗原 |
| 应用 | 使用多克隆抗体的理由依据 |
|---|---|
| ELISA检测抗体（直接、间接、夹心和捕获ELISA法） | 结合多个抗原表位以交付多种检测分子。 |
| ELISA捕获抗体 | 多反应性可以最大限度地从样品中回收抗原。 |
| 蛋白质印迹检测抗体 | 多表位识别可以实现抗原改变（变性/线性化） |
| 治疗性抗体药物 | 通过大量抗体来识别靶点，以实现最大化的药物输送、免疫招募、封闭或活化。 |
| 临床试验 | 可潜在提升检测能力。 |
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